甘蓝变种驯化隐藏驱动力揭示
2月19日,甘蓝记者从中国农业科学院蔬菜花卉研究所获悉,变种该所蔬菜分子设计育种创新团队和甘蓝类蔬菜遗传育种创新团队,驯化联合荷兰瓦赫宁根大学植物育种系生长与发育团队,隐藏构建了高质量的驱动甘蓝泛基因组和图形基因组,揭示了结构变异驱动甘蓝形态类型多样化的力揭快速驯化。相关成果日前发表在国际期刊《自然·遗传学》上。甘蓝
中国科学院院士钱前认为,变种这项研究通过泛基因组和大规模多组学数据分析,驯化揭示了甘蓝类蔬菜作物如何在较短时间内驯化出多样的隐藏变种类型,以及结构变异调控基因表达是驱动甘蓝多样性进化的“分子加速器”这一重要规律。
该研究首先基于700余份甘蓝野生种和覆盖所有变种材料的力揭重测序数据构建了系统发育树,发现甘蓝变种主要起源于两个独立的甘蓝驯化事件。研究团队据此选取了22个具有代表性的变种野生甘蓝和变种材料,利用测序技术构建了染色体水平的驯化高质量基因组。“与已有的甘蓝基因组相比,此次新构建的基因组在序列连续性、着丝粒完整性等方面都有显著提升。此外,研究进一步构建了甘蓝的图形基因组,并从中挖掘到一批在不同变种中受到特异性驯化选择的结构变异及相关基因。这有助于我们更好地理解甘蓝的驯化历史和变种形成的机制。”论文共同通讯作者、中国农业科学院蔬菜花卉研究所研究员程锋说。
中国科学院院士、中国热带农业科学院院长黄三文认为,这篇论文是十字花科作物驯化研究的重大成果,揭示了甘蓝变种的重要驯化机制。这项研究同时也构建了迄今为止规模最大、质量最高的甘蓝泛基因组。
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